Bệnh viện Phạm Ngọc Thạch là bệnh viện hạng I trực thuộc Sở Y tế thành phố Hồ Chí Minh. Theo Quyết định phân công công tác chỉ đạo tuyến trong lĩnh vực khám, chữa bệnh, ban hành kèm theo Quyết định số 4026 /QĐ-BYT ngày 20 tháng 10 năm 2010 của Bộ trưởng Bộ Y tế, bệnh viện Phạm Ngọc Thạch phụ trách chỉ đạo tuyến trong lĩnh vực khám, chữa bệnh cho chuyên khoa Lao và Bệnh Phổi các tỉnh/thành phố Miền Nam. Bệnh viện có 09 phòng chức năng, 04 khoa cận lâm sàng, 08 khoa lao (498 giường bệnh), 3 khoa bệnh phổi (165 giường bệnh), 01 khoa Nhi (66 giường bệnh), 01 khoa Cấp cứu Ngoại chẩn (54 giường bệnh), 01 khoa Hồi sức Cấp cứu (66 giường bệnh), 01 khoa Hóa trị Ung thư (55 giường bệnh), 01 khoa Ngoại Lồng ngực (4 phòng mổ, 55 giường bệnh tiền phẫu, 12 giường bệnh Hồi sức Ngoại khoa), 01 khoa Khám (trung bình có 1.024 bệnh nhân khám, điều trị ngoại trú/ngày), 01 khoa Kiểm soát nhiễm khuẩn, 01 khoa Phục hồi Chức năng, 01 khoa Dược.

Bệnh viện là nơi hoạt động của một tập thể các nhân viên y tế có tay nghề cao cả nội và ngoại khoatrong lĩnh vực lao và bệnh phổi, đặc biệt là trong lĩnh vực phẫu thuật lồng ngực, chẩn đoán và hoá trị ung thư phế quản phổi, bệnh phổi không lao và lao.

• Chấn thương chỉnh hình  
• Cột sống  
• Dược
• Hô hấp  
• Hồi sức  
• Cấp cứu
• Kiểm soát nhiễm khuẩn  
• Nhi  
• Truyền nhiễm
• Ung bướu  
• Vật lý trị liệu