Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới có 280 giường bệnh, 7 phòng chức năng, 5 khoa lâm sàng và 5 khoa cận lâm sàng cùng với 1 trung tâm đào tạo - chỉ đạo tuyến.

Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương là nơi điều trị những bệnh Truyền nhiễm, Nhiệt đới đảm bảo chất lượng hàng đầu, hiện nhận được sự tin cậy của người bệnh. Bệnh viện trang bị phòng cách ly áp lực âm thuộc loại hiện đại trên thế giới.

Hiện nay bệnh viện đã áp dụng công nghệ thông tin cho nhiều hoạt động như khám, chỉ định xét nghiệm, kê đơn thuốc, lưu trữ bệnh án, viện phí,... Đồng thời tại đây có hệ thống wifi internet miễn phí. Có hệ thống hội thảo trực tuyến, kết nối giữa bệnh viện với những bệnh viện lớn trong nước cùng một số nước trên thế giới.

Đây luôn là nơi đi đầu và làm nòng cốt khi có dịch bệnh nguy hiểm và những dịch bệnh mới xuất hiện. Trong những năm vừa qua, dưới sự chỉ đạo của Bộ y tế bệnh viện đã nhanh chóng dập tắt các dịch nguy hiểm như: cúm gia cầm H5N1, cúm A H1N1, SARS, dịch tiêu chảy cấp nguy hiểm, dịch sởi, liên cầu lợn, sốt phát ban,...

Ngoài việc tổ chức cũng như chỉ đạo chống dịch bệnh viện đã tham gia cùng Bộ Y tế xây dựng phác đồ chẩn đoán và điều trị các bệnh Truyền nhiễm và Nhiệt đới.

Đối với lĩnh vực hợp tác quốc tế, bệnh viện hợp tác với nhiều nước trên thể giới như Úc, Hoa Kỳ, Anh, Nhật Bản,... nhằm chia sẻ thông tin cũng như xây dựng mạng lưới cảnh báo dịch bệnh, giúp tạo thêm nguồn lực góp phần nâng cao chất lượng về cơ sở vật chất của bệnh viện cũng như trình độ cán bộ nhân viên qua dự án hợp tác, viện trợ hay hỗ trợ học tập tại nước ngoài...

• Chẩn đoán hình ảnh  
• Dinh dưỡng  
• Dược
• Hồi sức  
• Cấp cứu  
• Huyết học
• Truyền máu  
• Khám bệnh  
• Kiểm soát nhiễm khuẩn
• Tiêu hóa  
• Gan mật